W konfiguracji (Katalog/Magazyn/Pokazuj produkty których brak w magazynie) masz opcję automatycznego wyłączania produktu jeśli stan = 0.
A jak je wrzucić na koniec listy? na chłopski rozum sortowanie wg ilości, ale bez modyfikacji w szablonie raczej się nie obędzie. Opcja pokazywania mimo stanu zerowego przydaje się, jeśli masz regularne dostawy albo chcesz włączyć subskrypcję / powiadomienia o dostawie dla klientów.