Cześć,
Najszybciej można to zrobić poprzez export produktów od pliku csv - System->import/export and select Export.
Następnie z tego pliku wycinamy produkty które chcemy przenieść, podmieniamy im kategorię i zapisujemy (wystarczą dwie kolumny: SKU i _category).
Taki plik importujemy z powrotem do systemu. Przeładowujemy indeksy, cache i zmiany powinny być widoczne. 
Jak zawsze trzeba pamiętać o backupie bazy przed całą operacją w razie niepowodzenia.
            
                        Aktualizacje do najnowszej wersji, zmiany wyglądu, nowe funkcjonalności, moduły na zamówienie - Magento dopasowane do 
Twoich potrzeb.
